Фамилия Якубин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якубин послужило церковное имя Иаков. Имя Якуба является польской формой крестильного мужского имени Яков (Иаков), которое проникло сначала на Украину и в Белоруссию, а оттуда – на Смоленщину. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Святыми покровителями имени Иаков считаются: Иаков Алфеев, апостол из двенадцати, брат святого евангелиста Матфея (день памяти- 13 июля (30 июня), 22 (9) октября); Иаков Брат Господень по плоти, апостол из семидесяти, священномученик (день памяти - 17(4) января, 5 ноября (23 октября)); Иаков Железноборовский, преподобный, ученик преподобный Сергия Радонежского (день памяти - 24 (11) апреля, 18 (5) мая) и многие другие святые. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якуба, со временем получил фамилию Якубин. О точном месте и времени возникновения фамилии Якубин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якубин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.