Фамилия Ямгутдинов — яркий пример того, как русская фамильная модель усвоила тюрко-мусульманское личное имя. В основе лежит мужское имя Ямгутдин, которое, как и многие татарские и башкирские имена, состоит из двух частей. Первая — «ям» — восходит к древнетюркскому «йам» (дорога, путь, почтовая станция) или к персидскому «джам» (чаша, собрание), но чаще её связывают с арабским «йам» — «море», «океан», что в переносном смысле означает «великий», «безбрежный». Вторая часть — «утдин» (от арабского «ад-дин» — «вера», «религия»). Таким образом, имя Ямгутдин можно истолковать как «море веры» или «океан религии» — образ, подчёркивающий глубину и широту религиозного чувства.

Фамилия образована по классическому русскому патронимическому шаблону: к основе Ямгутдин прибавлен суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Ямгутдина»). В татарской и башкирской среде такие фамилии на -ов/-ев массово закрепились в XIX веке после введения всеобщей переписи и воинской повинности, когда людям без фамилий давали их по имени отца. Следовательно, предок носителя этой фамилии — человек по имени Ямгутдин, скорее всего, живший в конце XVIII — первой половине XIX века.

Географически фамилия Ямгутдинов наиболее распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Это зона расселения волго-уральских татар и башкир, где подобные арабо-тюркские имена с компонентом «дин» (Гайнутдинов, Хайрутдинов, Сафиуллин) — обычное дело. Встречаются варианты написания Ямгутдинов и Ямгутдинов — разница в ударении или в диалектном произношении, но корень тот же.

Интересно, что имя Ямгутдин — не самое частое среди татаро-башкирских имён, поэтому фамилия Ямгутдинов относительно редкая. В отличие от массовых Гайнутдиновых или Хайрутдиновых, она выделяется более редкой первой частью «ям», что делает её более локальной и, возможно, указывает на происхождение из конкретного села или рода, где имя Ямгутдин было традиционным на протяжении нескольких поколений. Сословно предки могли быть как крестьянами-земледельцами, так и торговцами или служилыми людьми (например, ямщиками или казаками) — имя не даёт прямого указания на профессию, но вписано в общую историю татарского и башкирского крестьянства и мещанства.