Фамилия Янинко — редкий пример фамилии, в которой суффикс указывает на географию происхождения точнее, чем корень. Суффикс -ко в украинской, реже белорусской, антропонимии — один из самых продуктивных: так образовывали фамилии от имени или прозвища отца, часто с уменьшительным или фамильярным оттенком (сравните: Иван — Иванко, Гриць — Грицько). Следовательно, Янинко — это «сын Яна» или «потомок Яна».

Основа Ян- — это западнославянская и южнославянская форма имени Иван (от древнееврейского Йоханан — «Бог помиловал»). В русской среде имя Ян до XX века было редкостью, а вот на Украине, в Беларуси и Польше оно бытовало широко. Поэтому Янинко — фамилия, скорее всего, украинская или белорусская, а не великорусская. Если бы фамилия закрепилась в русском регионе, она получила бы суффикс -ов или -ин: Янин или Янов.

Интересная деталь: в украинской ономастике фамилии на -енко (вроде Яненко) встречаются чаще, чем на -инко. Вариант Янинко мог возникнуть в говорах, где суффикс -ин присоединялся к основе, а затем добавлялось уменьшительное -ко (Ян + ин + ко). Либо это результат полонизации: в польском языке фамилии на -инко встречаются как раз в восточных кресах, на границе с украинскими землями.

Сословная принадлежность предков неясна: суффикс -ко не был дворянским (шляхта чаще носила фамилии на -ский), но и не указывает на крепостную зависимость. Скорее всего, Янинко — фамилия казацкой или мещанской среды, где сына называли по отцу без привязки к поместью. Встречается она преимущественно в западных и центральных областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Сибири.

Короче: если ваша фамилия Янинко, то предки жили там, где говорили на украинском или смешанных говорах, а родоначальника звали Ян — то есть Иван по-местному. Фамилия не древняя аристократическая, но и не искусственная — её породила живая речь, где «Янинко» значило просто «Янов сын».