Фамилия Янотовская звучит как типичная дворянская или шляхетская фамилия, и это не случайно. Её основа — суффикс -ск-, который в русской и польской ономастике указывает на принадлежность к месту или роду. Чаще всего такие фамилии получали владельцы поместий или выходцы из определённой местности. В данном случае в основе лежит топоним — название населённого пункта вроде Янотово, Янотов или Янотовка. Такие названия встречаются в Польше, Беларуси и на западе России, и происходят они от имени Ян (польский аналог Иоанна, то есть Иван). Таким образом, Янотовская — это буквально «та, что из Янотова» или «принадлежащая к роду Янотовских».

Форма Янотовская — женская, мужской вариант будет Янотовский. Окончание -ая в русском языке закрепилось при адаптации польских фамилий, где в женском роде используется -а (Янотовска). В Польше такие фамилии носили в основном шляхтичи, владевшие землёй в одноимённых деревнях. В России после разделов Речи Посполитой фамилия могла перейти к потомкам польской или белорусской шляхты, которые сохранили написание через «о» (Янотовский) или русифицировали его.

Есть и более редкая версия происхождения — от прозвища Янот. В некоторых говорах «янот» могло быть искажением слова «енот» (зверёк), но такое объяснение маловероятно для фамилии на -ск-, которая почти всегда территориальная. Кроме того, имя Ян в качестве основы даёт и другие однокоренные фамилии: Яновский, Янович, Янов. Янотовская выделяется среди них редким суффиксом -ов- перед -ск-, что указывает на конкретный топоним с основой на -ово.

Географически фамилия встречается в основном на западе России, в Беларуси и среди потомков переселенцев из этих регионов. В дореволюционных метрических книгах Янотовские могли фигурировать как дворяне, но встречались и среди крестьян, если их предки получили фамилию от названия деревни, где жили. Сословная принадлежность здесь неоднозначна: шляхетский корень не гарантирует высокого статуса, так как многие мелкопоместные дворяне со временем сливались с крестьянством.

С точки зрения словообразования это классическая «географическая» фамилия: корень Ян-, суффикс -ов- (указывает на принадлежность к объекту), суффикс -ск- (связь с местностью) и окончание -ая. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Яно́товская, хотя в разговорной речи встречается вариант Яното́вская.