Фамилия Ягодовская — редкий пример, где прозрачная основа «ягода» сочетается с окончанием, которое чаще встречается у польской или западнорусской шляхты. На первый взгляд кажется, что предок торговал ягодами или жил у ягодного места, но суффикс -овск- указывает на другую историю.

Модель образования типична для фамилий на -ский/-цкий: так называли владельцев поместья или выходцев из села с названием Ягодово, Ягодовка. Таких топонимов немало в Беларуси, на Украине и в западных областях России — например, деревня Ягодово в Смоленской области или Ягодовка в Черниговской. Человек, переехавший оттуда, получал прозвание «Ягодовский», то есть «из Ягодова». Со временем фамилия закрепилась за потомками, даже если те уже не имели отношения к деревне.

Суффикс -ск- в русской традиции часто ассоциируется с дворянскими фамилиями (по модели князей и помещиков), но в реальности Ягодовские могли быть и крестьянами, и мещанами — просто их предки жили в месте, названном по ягодным угодьям. В польской ономастике фамилии на -owski (Ягодовский) тоже распространены, и там они нередко указывали на владение землёй, но не обязательно на высокий статус.

Менее вероятная, но возможная версия — образование от прозвища Ягода (ласковое или ироничное имя человека) с добавлением суффикса -овский. В таком случае фамилия означала бы «принадлежащий Ягоде» или «из семьи Ягоды». Однако для прозвищ чаще использовали простые суффиксы -ов/-ин (Ягодов, Ягодин), а -ский — признак топонимического происхождения.

Форма Ягодовская — женский вариант, но в истории фамилии встречаются и мужские носители: Ягодовский. Встречаемость фамилии невысокая, она сосредоточена в западных регионах бывшей Российской империи и в диаспоре. Сословный состав предков определить сложно: в актах XVIII–XIX веков Ягодовские записаны и как крестьяне, и как однодворцы, и как мелкопоместные дворяне — всё зависело от конкретного села.