Фамилия Янтсоон — почти наверняка не русская, а эстонская или финская по происхождению. Её выдает характерная модель образования: суффикс -соон, который в эстонском и финском языках означает «сын». То есть Янтсоон буквально переводится как «сын Янта». Янт — это краткая, разговорная форма имени Йоханнес (русский аналог — Иван). Таким образом, фамилия строится по той же логике, что и шведские Андерссон или Нильссон, но в местном, прибалтийско-финском варианте. В Эстонии и Финляндии такие фамилии массово закреплялись в конце XIX — начале XX века, когда крестьянам предписали иметь постоянные родовые имена.

Можно предположить, что предки носителя фамилии жили на территории современной Эстонии или среди эстонских переселенцев. В русском контексте фамилия крайне редкая и почти не встречается за пределами семей, сохранивших память о прибалтийских корнях. В самой Эстонии фамилия Янтсоон (Jantsoon) тоже не относится к массовым, но её словообразовательная модель прозрачна.

С точки зрения этимологии, основа Янт — это не самостоятельное имя, а именно уменьшительная форма от Йоханнес. В эстонском языке имя Jaan (Яан) — основной вариант, а Янт — его диалектный или обиходный вариант. Суффикс -t в эстонских именах часто придаёт оттенок ласкательности или просторечия, как в именах Mihkel — Mihkelt, Tõnu — Tõnut. Поэтому фамилию Янтсоон можно понимать как «сын маленького Яана» или «сын Яана (в домашнем кругу)».

В русских документах фамилия могла записываться с искажениями: Янтсон, Янцоон или даже Янтзоон, так как звук [ts] передавали разными способами. Если вы встретили вариант Янтсоон именно с двумя «о», это указывает на эстонское правописание, где долгий гласный обозначается удвоением. В Финляндии аналогичная фамилия писалась бы как Jantsoo или Jantsonen, но форма на -соон типична для эстонской ономастики.

Таким образом, Янтсоон — фамилия-отчество, которая чётко указывает на имя отца (Янт = Йоханнес) и на регион бытования (Эстония или прилегающие территории). Она не имеет отношения к русским фамилиям на -ов/-ев и не связана с каким-либо ремеслом или прозвищем. Это чистая генеалогическая метка: «чей сын».