Фамилия Явгильдин — одна из тех, что сразу выдают тюркское происхождение. Её основа — мужское имя Явгильда, которое состоит из двух частей: «яв» (добрый, благой) и «гильда» (пришёл). Вместе это значит «пришёл добрый» или «благой пришёл». Такие имена-пожелания были распространены у башкир и татар: родители надеялись, что ребёнок принесёт в дом счастье и удачу. Суффикс -ин (вместо более привычного -ов) указывает на то, что фамилия образована по русской модели притяжательных прилагательных от имени, оканчивающегося на гласный или мягкий согласный. То есть Явгильдин буквально означает «сын Явгильды», «принадлежащий Явгильде».

Географически фамилия почти целиком привязана к Башкортостану и соседним регионам — Оренбургской, Челябинской областям. Это не случайно: имя Явгильда (встречается также вариант Яугильда) типично именно для башкирской антропонимии. В татарской среде оно тоже бытует, но реже. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилия почти не встречается — это говорит о том, что она оформилась поздно, скорее всего, уже в советское время, когда паспортизация закрепила за семьями единую форму.

Любопытная деталь: в некоторых говорах башкирского языка «яв» может означать не только «добро», но и «враг» (от арабского «йав» — война). Поэтому ономасты иногда предлагают вторую версию: Явгильда как «враг пришёл» — обережное имя, которое давали, чтобы обмануть злых духов. Однако эта гипотеза слабее: в тюркской традиции имена с компонентом «яв» в значении «хороший» зафиксированы гораздо чаще, а обережные имена обычно строились на откровенно неблагозвучных основах (например, Байрамгул — «праздник пришёл»), а не на двусмысленных.

По сословному происхождению носители фамилии, скорее всего, были из государственных или удельных крестьян, реже — из тептярей (сословие, близкое к башкирам и татарам). Дворянских родов с такой фамилией не известно. В современной России Явгильдиных немного — около тысячи человек, и почти все они сохраняют связь с исторической родиной.