Фамилия Яяйкин — редкий случай, когда основа настолько необычна, что сразу вызывает вопрос: откуда она взялась? Разберёмся по порядку, без лишних догадок.

В русской антропонимии суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Яяйкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Яяйка. Само прозвище Яяйка, скорее всего, образовано от диалектного или просторечного слова «яяй» — так в некоторых говорах (особенно северных и сибирских) произносили междометие «ай-яй» или «ой-ой», выражающее удивление, испуг или сожаление. Человека могли прозвать Яяйкой за привычку часто повторять это восклицание, за суетливость или за манеру охать при разговоре.

Есть и другая версия, более прозаичная. В русских говорах слово «яяй» иногда означало яйцо (детское или диалектное произношение). Тогда Яяйка — это прозвище, данное либо маленькому ребёнку, либо человеку с круглым лицом или лысой головой, напоминающей яйцо. Такие прозвища по внешности — распространённое явление (сравните с фамилиями Головин, Лысёнков). Однако версия с междометием кажется более правдоподобной, поскольку слово «яйцо» в диалектах чаще звучало как «яйко» или «яичко», а не «яяй».

Фамилия Яяйкин — очень редкая. Встречается преимущественно в Поволжье и некоторых районах Сибири, куда переселялись крестьяне из центральных губерний. Сословно предки были, скорее всего, крестьянами или мещанами — фамилии на -ин из прозвищ характерны именно для этих слоёв, а не для дворянства.

В написании фамилии нет никаких исторических разночтений: двойное «я» в начале — не опечатка, а точная фиксация прозвищной основы. В документах XIX века могли писать «Яяйкинъ» с твёрдым знаком на конце, но корень оставался неизменным. Сегодня носители фамилии — люди, чьи предки когда-то получили это забавное и запоминающееся прозвище, закрепившееся в официальном родовом имени.