Фамилия Яйтынова — редкая, и её разбор требует внимания к непривычному для русского уха корню. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, адаптированная русской моделью на -ов/-ев. В основе лежит мужское имя или прозвище Яйтын, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «яй» — лето, или к глаголу со значением «расстилать», «развертывать». В тюркских языках имя Яйтын могло означать «летний», «рожденный летом» или же «широкий», «просторный» — прозвище, данное по характеру или внешности.

Суффикс -ов присоединился к основе, когда фамилию русифицировали: Яйтын + ов = Яйтынов, а женская форма Яйтынова. Такая модель типична для фамилий, вошедших в русский обиход из национальных окраин империи. Географически фамилия, вероятно, привязана к регионам с тюркским населением — Поволжье (татары, башкиры), Северный Кавказ или Южный Урал.

Вторая, менее вероятная версия — что корень восходит к тюркскому «яйт» (запрет, табу) и указывает на человека, налагавшего ограничения, или на того, кто сам избегал чего-то. Но это гипотеза слабая, так как подобные основы редки в прозвищах.

Скорее всего, предки носительницы фамилии были крестьянами или казаками из тюркоязычной среды, которые получили фамилию по имени основателя рода. Сведений о знатных родах Яйтыновых в дворянских книгах нет, что подтверждает её простонародное, позднее происхождение — не ранее XVIII века, когда массово закреплялись фамилии у нерусского населения.