Фамилия Яжейкин — редкая, и её происхождение не сразу бросается в глаза. Если отбросить типичный русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»), остаётся основа «Яжейк-». Скорее всего, перед нами не полное имя, а уменьшительная форма от крестильного имени. В основе лежит имя Иаков (церковнославянская форма библейского Иакова, в народе — Яков). В диалектах и бытовой речи имя Яков могло превращаться в «Яжей» или «Яжейка» через чередование звуков и добавление просторечного суффикса -ей-. Такая модель встречается в русских фамилиях, образованных от народных вариантов имён: скажем, от «Яша» получались Яшин, от «Яней» (форма от Иван) — Янейкин, а от «Яжей» — Яжейкин.

Версия с прозвищем менее вероятна, но не исключена. В некоторых говорах «яжей» могло быть искажением слова «ежей» (от «ёж»), но тогда фамилия звучала бы как Ежейкин. Скорее всего, предок носителя фамилии был сыном человека по прозвищу Яжейка — то есть маленького Якова. Суффикс -ин здесь работает по стандартной схеме: «Яжейкин» означает «сын Яжейки».

География фамилии узкая. Яжейкины встречаются в основном в центральных и северных областях России, где была распространена традиция образовывать фамилии от уменьшительных форм имён с суффиксом -ей-. Это не дворянская и не купеческая фамилия — скорее всего, она принадлежала крестьянам или посадским людям, чьи предки получили прозвище в быту и не претендовали на громкое родство.

Любопытно, что фамилия могла писаться через «о» — Яжойкин, если в основе лежал вариант «Яжойка». Но в современном написании закрепилась форма с «е», что подчёркивает её связь именно с именем Яков, а не с каким-то другим корнем. Других однокоренных фамилий в русском языке почти нет — это делает Яжейкиных уникальными носителями старой, почти исчезнувшей модели имяобразования.