Фамилия Юкнюс — редкая для русской среды и явно не славянского происхождения. Её структура сразу выдает литовский или жемайтский след: окончание -юс характерно для литовских фамилий, особенно тех, что прошли русификацию в XIX веке. В оригинале фамилия могла звучать как Juknius или Juknis, а на русскую почву её адаптировали, отбросив литовское окончание -is или заменив его на -юс.

Корень Юк- восходит к литовскому личному имени Jukas, которое является сокращённой формой от имени Juozapas (Иосиф). То есть фамилия Юкнюс в основе — патроним, указывающий на отца по имени Юкас или Юкнюс. В литовской антропонимике такие фамилии на -юс часто означали «сын такого-то»: Юкнюс — «сын Юкаса». Встречаются и другие версии: у литовцев есть слово jukė — «пень», «колода», и фамилия могла быть прозвищной, закрепившейся за человеком коренастого сложения или упрямого нрава. Но первая версия — патронимическая — более правдоподобна, так как суффиксальная модель -юс в Литве массово образовывала именно отчества.

В Российской империи после отмены крепостного права литовские крестьяне часто получали фамилии именно по имени отца, и форма с окончанием -юс фиксировалась в метрических книгах. Географически фамилия Юкнюс привязана к северо-западным губерниям: Ковенской, Виленской, частично Сувалкской. Сейчас носители встречаются в Литве, а в России — в Калининградской области, а также среди потомков литовских переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.

Интересная деталь: фамилия Юкнюс могла писаться и как Юкнис, и как Юкнюс — в зависимости от того, как чиновник на слух записывал литовский говор. Встречаются варианты с удвоенной «н» — Юкнюсс, но это уже поздняя канцелярская описка. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он был крестьянином или мелким ремесленником из западных губерний, а сама фамилия — простое указание на отца по имени Юкас.