Фамилия Юнатанова — одна из тех, где с первого взгляда понятна основа, но при ближайшем рассмотрении вскрывается неочевидная история. Корень «юнат» — это, конечно, «юный натуралист», советское массовое движение школьников, возникшее в 1920-е годы. Однако фамилия эта не могла возникнуть в XX веке по законам русской антропонимии: суффикс -ов- указывает на патронимическую модель, которая сложилась в основном в XVI–XVII веках. Значит, перед нами случай, когда советское слово легло на уже существовавшую фамилию, изменив её написание или произношение, либо сама фамилия имеет совсем другую природу.

Скорее всего, исходная форма — Юнатанов или Юнатов. Суффикс -анов характерен для фамилий, образованных от основ на -а (Юната → Юнатанов). Сама основа «Юнат» может быть разговорной или диалектной формой имени Ионат (от библейского Иона) или уменьшительной от Иуда (в народном произношении Юда). В таком случае Юнатанов — это «сын Юнаты», то есть человека, которого в быту звали уменьшительным именем Юната. Вторая версия, менее вероятная, но возможная для южных регионов: связь с тюркским словом «юнат» (молодой, юный) — такое прозвище мог дать соседям или пришлым людям.

География фамилии сегодня размыта, но по косвенным данным (встречаемость в базах данных) Юнатановы чаще фиксируются в центральных областях России и в Поволжье, где были сильны старообрядческие общины, сохранявшие архаичные формы имён. Женская форма Юнатанова, соответственно, появилась как вариант для замужней женщины или дочери, но в современном употреблении это уже самостоятельная фамилия, не меняющаяся по полу.

Интересная деталь: фамилия Юнатанова не имеет отношения к «юннатам» в прямом смысле, но в советское время носители могли столкнуться с забавной омонимией — их фамилию воспринимали как «идейную», хотя корни её уходят в дореволюционную эпоху. Это пример того, как старый антропоним «перекрашивается» под новую эпоху, оставаясь верным своей словообразовательной модели.