Фамилия Юнусбекова образована от мужского имени Юнусбек. Это составное имя тюркского происхождения, где первая часть — Юнус — восходит к арабскому имени пророка Ионы (Юнус в исламской традиции). Вторая часть — бек — означает «господин», «князь», «предводитель» в тюркских языках. Таким образом, имя Юнусбек можно перевести как «господин, подобный Юнусу» или «князь Юнус».

Фамилия Юнусбекова — женская форма, указывающая на принадлежность к роду человека по имени Юнусбек. Мужской вариант — Юнусбеков. Суффикс -ов/-ев характерен для русской модели образования фамилий, но в данном случае он присоединён к восточному имени, что типично для фамилий народов Северного Кавказа, Поволжья и Средней Азии, где в XIX–XX веках при переходе к русской паспортной системе местные имена русифицировали.

Географически фамилия Юнусбекова наиболее распространена среди дагестанских народов, особенно у кумыков и аварцев, а также встречается у татар и башкир. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были людьми знатного происхождения или уважаемыми в общине, так как компонент «бек» в имени традиционно подчёркивал социальный статус.

Любопытная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, которые образуются от прозвищ или профессий, Юнусбекова напрямую связана с религиозным именем. Имя Юнус (пророк Иона) почитается в исламе, и его использование в составе сложного имени говорит о глубокой религиозной традиции в роду. Фамилия не имеет альтернативных версий происхождения — она однозначно патронимическая, то есть указывает на отца или деда по имени Юнусбек.