Фамилия Юркшене звучит не по-русски, и это верная подсказка: перед нами литовская фамилия в женском роде. В Литве и соседних регионах фамилии имеют чёткую родовую форму: мужская оканчивается на -ас, -ис, -ус (Юркшас, Юркшис, Юркшус), а женская — на -ене (для замужней женщины) или -айте/-уте (для дочери). Таким образом, Юркшене — это «госпожа Юркшас» или «жена Юркшиса».

Основа фамилии — корень Юркш-. Скорее всего, он восходит к литовскому личному имени Юргис (литовская форма Георгия) или к его уменьшительным вариантам. В литовской антропонимике суффикс -кш- характерен для сокращённых и ласкательных форм имён. Например, от Юргис могли образоваться формы Юрка, Юркус, а далее — Юркша. То есть прозвище Юркша могло означать «маленький Юргис» или просто «Юрка».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с литовским глаголом jurkti (сердиться, хмуриться) или со словом jurkšti (моросить, накрапывать). В таком случае прозвище могло характеризовать человека с угрюмым нравом или относиться к сырой, дождливой погоде. Однако первая версия — от имени — встречается в Литве чаще и считается более правдоподобной.

Встречаемость фамилии Юркшене в России крайне низкая. Носительницы этой фамилии — почти наверняка литовки по происхождению, либо потомки литовских переселенцев. В самой Литве фамилия Юркшене (и мужские варианты Юркшас, Юркшис) распространена в основном в северных и центральных районах страны, особенно в окрестностях Шяуляя и Паневежиса.

В документах XIX — начала XX века, когда Литва входила в состав Российской империи, фамилию могли записывать на русский лад: Юркшене, Юркшина или даже Юркшева. Но исходная литовская модель сохранилась, и сегодня Юркшене — это именно женская форма, которая указывает на семейное положение. Если носительница фамилии выходит замуж, её фамилия сменится на фамилию мужа, а дочь будет носить форму Юркшайте.