Фамилия Юсев — редкий случай, когда основа не очевидна на первый взгляд. В ней нет привычного корня, связанного с ремеслом или внешностью. Скорее всего, перед нами патронимическая фамилия, образованная от имени или прозвища Юс.

Самая вероятная версия: имя Юс — это краткая форма от канонического имени Иуда (в русской традиции через греческое посредство звучавшего как Юда). В бытовой речи имя могло редуцироваться до Юс, а затем и до Юс. Фамилия на -ев указывает на принадлежность: «Юсев» буквально значило «сын (или потомок) Юса». Суффикс -ев, а не -ов, стоит после мягкого согласного, что грамматически правильно для такой основы. Имя Иуда в крестьянской среде не было редкостью, хотя после библейской истории с предательством его старались давать реже; тем не менее, в документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этим именем.

Есть и альтернативная, менее распространённая гипотеза: Юс могло быть прозвищем, образованным от древнерусского слова «юс» — так называли буквы кириллицы «юс малый» и «юс большой», обозначавшие носовые гласные. Прозвище мог получить грамотей, писец или человек с гнусавым голосом (поскольку носовые звуки произносились «в нос»). Однако эта версия слабее: прозвище по букве — большая редкость, а патроним от имени встречается постоянно. Скорее всего, предки носителей фамилии Юсев — это люди, носившие имя Юс, то есть крестьяне или горожане центральной России, где такие сокращения имён были обычны.

Географически фамилия встречается точечно, в основном в европейской части России, без ярко выраженного ареала. В дворянских родословных книгах она не зафиксирована — это фамилия простых сословий, возникшая не позднее XVII века, когда у крестьян и посадских массово закреплялись отчества в качестве фамилий. Фамилия Юсев — пример того, как за короткой и неочевидной формой стоит полноценное календарное имя, а вместе с ним — история человека, жившего несколько столетий назад.