Фамилия Юстер — редкая в русской среде, и её происхождение почти наверняка не славянское. Если не считать случайных единичных носителей, основная версия ведёт к немецкому или еврейскому (ашкеназскому) корню. В немецком языке существует фамилия Yuster или Juster, которая восходит к латинскому iustus — «справедливый», «честный» (через средневерхненемецкое juster). В таком случае фамилия могла быть прозвищем судьи, законника или просто человека, которого окружающие считали образцом честности. В еврейской среде фамилия Юстер (יוסטער) тоже встречается, и её значение то же — «справедливый», но она могла быть дана как искусственная, «украшающая» фамилия при массовом присвоении фамилий в Австрийской империи в конце XVIII — начале XIX века.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — топонимическая. В Германии есть несколько мелких населённых пунктов с названием Just или Juster, и фамилия могла указывать на выходца оттуда. Однако для русских носителей фамилии Юстер более правдоподобно немецкое происхождение: в XVIII–XIX веках в Российскую империю приезжало много немецких колонистов, ремесленников и специалистов. Фамилия могла закрепиться в среде поволжских немцев, прибалтийских немцев или городских цеховых мастеров.

Морфологически фамилия не имеет славянского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает на иноязычную основу. В русском языке она склоняется как существительное мужского рода: Юстер, Юстера, Юстеру. Женский вариант — Юстер (несклоняемая) или, реже, Юстерова, если фамилия была русифицирована. Судя по отсутствию типичных русских окончаний, носители фамилии в России — это либо потомки немецких колонистов, либо еврейские семьи, жившие в черте оседлости.

В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилия Юстер встречается крайне редко. Основные очаги — западные губернии (Волынская, Киевская, Подольская) и Поволжье. В советское время носители могли сменить фамилию на более «русскую» или эмигрировать. Сейчас в России фамилия остаётся малочисленной — по разным оценкам, не более нескольких сотен человек.

Из-за редкости фамилии и отсутствия массовых исторических источников строить развёрнутую генеалогию по одной только фамилии сложно. Но если ваши предки — Юстеры, стоит искать корни в немецких колониях на Волге или в западных губерниях Российской империи, а также обратить внимание на записи в метрических книгах лютеранских или иудейских общин.