Фамилия Юстратова — женская форма от Юстратов, а та, в свою очередь, восходит к мужскому имени или прозвищу Юстрат. Сразу стоит сказать, что это редкая и диалектная форма: в русских говорах имя Евстрат (каноническое Евстратий) часто «якали» и редуцировали, превращая в Юстрат. То есть перед нами народная, «простая» версия крестильного имени Евстратий, что в переводе с греческого означает «добрый воин» или «хорошо вооружённый». Такие переделки были нормой в крестьянской среде: из Евдокии получалась Овдотья, из Евстрата — Юстрат.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Юстратов — буквально «сын Юстрата» или «из семьи Юстрата». Это типичная модель русских фамилий-патронимов, которая закрепилась в XVI–XVII веках, когда крестьяне и посадские люди массово получали фамилии по имени отца. Таким образом, первый носитель фамилии был сыном человека по имени Юстрат.

Интересная деталь: фамилия почти не встречается за пределами России, что говорит о её сугубо местном, диалектном происхождении. Географически она тяготеет к центральным и южнорусским областям, где «яканье» и замена «е» на «ю» в начале слова были особенно сильны. Например, в воронежских и курских говорах могли сказать «Юстрат» вместо «Евстрат», и эта форма закрепилась в документах.

Встречается и вариант с ударением на второй слог — Юстра́тов, что подтверждает живую устную природу фамилии. По сути, Юстратова — это окаменевшее свидетельство того, как в русской деревне перекраивали церковные имена на свой лад, делая их более удобными для произношения. Никакой другой, не связанной с именем Евстрат, версии происхождения у этой фамилии нет — попытки вывести её от «юстиции» или «юстрации» (устаревшее «осмотр») лингвистически несостоятельны.