Фамилия Юсупходжаева — яркий пример восточной антропонимической модели, где личное имя соединяется с титулом или обозначением статуса. В основе лежит мужское имя Юсупходжа, которое состоит из двух частей: «Юсуп» — арабизированная форма библейского имени Иосиф (в исламской традиции — пророк Юсуф, означающий «Бог приумножит» или «прибавит»), и «ходжа» — почётный титул, восходящий к персидскому «хваджа» (господин, хозяин, наставник). В Средней Азии «ходжами» называли потомков пророка Мухаммеда или духовных лиц, а также уважаемых купцов и землевладельцев.

Суффикс «-ева» указывает на принадлежность: Юсупходжаева буквально значит «дочь (или жена) Юсупходжи». Это типичная для тюркских и иранских языков форма образования фамилий, которая в русской паспортной системе закрепилась через добавление славянского окончания. Фамилия встречается преимущественно в Узбекистане, Таджикистане и среди народов, исторически связанных с Ферганской долиной. В русскоязычных документах она могла писаться и как Юсупходжаев (мужской вариант), но женская форма сохраняет ту же основу.

Носительница этой фамилии — почти наверняка потомок человека, которого в общине называли уважительно: «господин Юсуф» или «наставник Юсуф». В отличие от фамилий, образованных от профессий (например, Кузнецов) или прозвищ, Юсупходжаева несёт в себе указание на социальный статус предка. Сама конструкция «имя + титул» как фамилия — редкость для славянского ономастикона, но обычна для исламского мира. Поэтому при взгляде на эту фамилию сразу видно: её корни не в крестьянской среде, а в среде духовенства или купечества, где титул «ходжа» передавался как часть родового имени.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия сохранила полную форму основы без усечения. В русском языке часто при заимствовании восточных имён отбрасывали конечный гласный (Юсупов от Юсуп), но здесь этого не произошло — вероятно, потому что «ходжа» воспринимался как отдельная значимая часть, а не окончание. Это делает фамилию узнаваемой и не даёт спутать её с более распространённой фамилией Юсупов.