Фамилия Южбенко — редкий случай, когда географическая основа сочетается с западноукраинской моделью фамилии, но при этом сама основа вызывает вопросы. С первого взгляда кажется, что корень «юж» отсылает к югу, южному направлению. Однако в украинской ономастике фамилии с таким корнем почти не встречаются в прямом значении «южный». Дело в том, что украинское слово «південь» (юг) не дало продуктивной модели для фамилий — в отличие, скажем, от русского «юг», породившего Югова, Южакова. Поэтому версия «предок был южанином» маловероятна: для этого в украинской среде использовали бы прозвище Південний или Полудень.

Гораздо убедительнее выглядит связь с антропонимом Южба — личным именем или прозвищем. В говорах западных областей Украины, особенно на Волыни и в Подолье, фиксировалось слово «южба» как вариант «ужба» — от «ужин» (вечерняя еда) или в значении «теснота, скученность». Но есть и более конкретная версия: в польских и украинских диалектах «юж» могло быть сокращением от имени Юзеф (Иосиф) через форму Юзько, Южа. Тогда Южба — это патроним (имя отца) в форме, характерной для польско-украинского пограничья. Суффикс -енко в этом случае работает как типичный украинский показатель «сын кого-то»: Южбенко — сын Южбы, то есть сын человека по прозвищу или имени Южба.

Фамилия почти не встречается в центральной и восточной Украине, её ареал — Тернопольская, Хмельницкая и, возможно, Львовская области. Это подтверждает западноукраинское происхождение. Интересно, что в польских метриках XVIII–XIX веков встречается фамилия Jużba (через ż), а её украинский вариант Южба — очень редок. Южбенко, таким образом, могла возникнуть как вторичная форма: сначала прозвище Южба, а от него — фамилия сына. Если сравнивать с однокоренными, то логичнее всего искать параллели среди фамилий на -енко от неканонических прозвищ: например, Кисленко (от кислый), Худобенко (от худоба). Южбенко стоит в том же ряду, только его основа сегодня непрозрачна.