Фамилия Залыпко — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, сохранив свою первоначальную экспрессивную окраску. В её основе лежит украинское или южнорусское слово «залыпати» — то есть залеплять, заклеивать, замазывать. В переносном смысле так могли назвать неаккуратного человека, который что-то делает наспех, кое-как, «лишь бы залепить». Но возможен и более конкретный, профессиональный оттенок: прозвище Залыпа мог получить маляр, штукатур или печник — тот, кто постоянно залепляет щели и трещины глиной или раствором.

Суффикс -к- в фамилии Залыпко — типичный украинский уменьшительный, который в фамилиях часто указывает на сына или младшего родственника. То есть Залыпко — это буквально «маленький Залыпа» или «сын Залыпы». В украинской ономастике такие фамилии на -ко очень часты (Шевченко, Коваленко), но здесь основа не от имени, а от прозвища, что делает фамилию более живой и «говорящей».

Географически фамилия тяготеет к восточным регионам Украины и югу России, где распространён говор с характерным «ы» на месте «и» (залыпать вместо залипать). Встречается она нечасто, и её носители, скорее всего, происходят из одной локальной группы — семьи, где прозвище закрепилось за конкретным мастеровым человеком. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Залыпко напрямую отсылает к занятию или черте характера предка, что делает её историю прозрачной, хотя и непарадной.