Фамилия Затолгутские — редкий пример, где основа прозвища почти не встречается в современных говорах. Слово «затолгут» в письменных источниках не зафиксировано, поэтому ономасты восстанавливают его через родственные корни. Вероятнее всего, прозвище Затолгут связано с сибирским словом «затолок» — так называли глухое место вдали от селений, от толпы и толкотни. Человек, получивший такое прозвище, мог жить отшельником в захолустье. Суффикс «-ут» в прозвище — редкая словообразовательная модель для русских фамилий, он встречается в единичных случаях и придаёт основе экспрессивный оттенок.

Менее убедительна версия, связывающая прозвище с существительным «затолока» — приправой к щам или каше (толчёное сало). В этом случае предок мог быть поваром, но объяснение выглядит натянутым: прозвища от названий блюд в русской традиции редки и обычно не образуют фамилий через суффикс «-ут». Ещё одна гипотеза отсылает к новгородскому выражению «затолчная дорога» — проселочная, малая дорога. Тогда прозвище могло указывать на место жительства у такой дороги, но и здесь связь с основой «затолгут» остаётся предположительной.

Фамилия оформлена типичным для восточнославянской аристократии и шляхты суффиксом «-ский». Такие фамилии в XVII–XIX веках часто получали выходцы из духовенства, мелкопоместные дворяне или переселенцы, записанные по названию местности. В случае Затолгутских фамилия могла закрепиться за целым родом, переселившимся из глухого угла в более обжитые места, — прозвище основателя стало родовым именем. Окончательно говорить о точном времени и месте возникновения фамилии можно лишь на основании генеалогических исследований, но уже сейчас ясно: она хранит память о географической или социальной отдалённости предков.