Фамилия Зайнышев — редкий пример, в котором тюркский корень соединился с русским патронимическим суффиксом. Основа здесь — тюркское имя Зайныш. Оно, в свою очередь, восходит к арабскому «зайн» — красота, украшение, достоинство. Имя Зайныш (или Зайниш) бытовало у татар, башкир, отчасти у казахов; дословно его можно перевести как «красавчик» или «украшение». Это не прозвище, а вполне традиционное личное имя, которое давали мальчикам с пожеланием стать хорошим, достойным человеком.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской среде, скорее всего, во второй половине XIX века, когда у татар и башкир начали массово записывать фамилии по русскому образцу. Модель проста: имя отца (Зайныш) превратилось в фамилию сына (Зайнышев). То есть Зайнышев — буквально «сын Зайныша». По сути, это классический отчество, застывшее в фамилии.

Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами Поволжья и Приуралья. Основной ареал — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. В старых переписях и ревизских сказках попадаются Зайнышевы среди тептярей и государственных крестьян. Дворянских родов с такой фамилией не было — она осталась крестьянской и мещанской, что типично для поздних тюркских фамилий, возникших после отмены крепостного права.

В русском языке фамилию часто путают с более распространённой Зайцев, но этимологически они не родственны. Если Зайцев — от прозвища «заяц», то Зайнышев — от личного имени, и общего корня тут нет. Встречается и вариант написания Зайнишев, но он ещё реже.

О редком суффиксе: -ышев — нестандартный для русских фамилий. Обычно в тюркских заимствованиях используют -ов/-ев или -ин. Форма на -ышев возникает, когда исходное имя оканчивается на -ыш (Зайныш, Батырш, Алтынш). Это маркер, что фамилия не переделана на русский лад, а записана почти фонетически, как слышали чиновники. Поэтому Зайнышев — не просто фамилия, а звуковой снимок того, как имя произносили в конкретной семье.