Фамилия Збыковский образована по польской модели с суффиксом -ский, который в польском и западнорусском контексте указывал на происхождение из конкретного места или на принадлежность к шляхте. Основа фамилии — топоним Збыково или Збыкув. Названий с корнем «збык-» в Польше и на западе современной Украины и Беларуси несколько: деревни Збыково есть в бывшей Гродненской губернии, а Збыкув — в Малопольше. Значит, первый носитель фамилии, скорее всего, был выходцем из такого села, причем уже в XV–XVII веках, когда фамилии на -ский активно закреплялись за местной шляхтой и зажиточными крестьянами.

Корень «збык-» не так прост. Самое вероятное объяснение — от польского глагола «zbyć» (избавиться, сбыть) или от существительного «zbytk» (излишек, шалость). В таком случае Збык — это прозвище человека, который был либо расточительным, либо, наоборот, умел сбывать товар, либо жил в достатке. Есть и версия, что корень восходит к древнепольскому имени Збыслав (через сокращение Збык), но она слабее: фамилии на -ский редко образуются напрямую от личных имен без топонимической прослойки.

На восточнославянских землях фамилия Збыковский встречается редко и почти всегда указывает на польское или ополяченное происхождение рода. В Российской империи носители такой фамилии могли быть из числа мелкой шляхты, которая после разделов Речи Посполитой перешла в податные сословия или подтверждала дворянство через герольдию. В современной России и Беларуси фамилия остается малочисленной, но без труда опознается как польская по форме.