Фамилия Зедгенизова — один из тех редких случаев, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. В основе лежит топоним Зедгенидзево или Зедгенидзе — название грузинского села или фамилия грузинского происхождения. Суффикс -ов в русском окончании (Зедгенизов) и последующее женское окончание -а указывают на то, что перед нами типичная русская адаптация иноязычной фамилии: носительницу звали, например, «Зедгенизова жена» или «Зедгенизова дочь».

Корень «Зедгенидзе» — это грузинская фамилия, образованная от личного имени Зедгени (возможно, сокращение от Зедгенидзе, где -дзе — патронимический суффикc «сын»). В русской среде суффикс -дзе, непривычный для уха, могли отбросить или заменить на -ов, получив Зедгенизов. Такая модель встречается у фамилий, которые принесли в Россию выходцы с Кавказа, осевшие в казачьих областях или среди крестьян южных губерний.

Спорных версий немного. Иногда Зедгенизову связывают с осетинским «зæд» (ангел, святой) или с тюркским «зед» (вред, ущерб), но эти гипотезы слабее: ни одна из них не объясняет характерный суффикс -идзе/-енидзе. Правдоподобнее всего, что предок носительницы фамилии был грузином, переселившимся в русскоязычную среду, или русским, получившим прозвище по месту жительства — из села Зедгенидзево.

Фамилия крайне редкая. По данным переписей и телефонных справочников, основные очаги — Ставропольский край, Ростовская область и Краснодарский край, то есть регионы, где исторически смешивались русское и кавказское население. Встречаемость в других областях единична. Это подтверждает версию о локальном происхождении: фамилия не разошлась широко, а осталась в пределах одного-двух родов.