Фамилия Зепс, несмотря на своё латышское звучание, скорее всего, имеет славянские корни. В её основе лежит древнее слово «зеп» — так в ряде славянских диалектов называли карман, мошну или кошель. Прозвище Зеп, от которого пошла фамилия, могли дать человеку зажиточному — купцу или торговцу, у которого «зеп» всегда был полон. Модель образования проста: к основе Зеп добавился латышский патронимический суффикс -с, что указывает на балтийское влияние, но не меняет славянской сути корня.

Существует и другая версия, но она куда менее правдоподобна: будто фамилия восходит к немецкому слову Sepie («каракатица»). Такое объяснение выглядит натянутым — в ономастике нет устойчивой традиции давать прозвища по головоногим моллюскам, а вот прозвища по имущественному положению встречаются сплошь и рядом. Поэтому версия с «карманом» остаётся основной.

Фамилия Зепс — редкая, её носители в основном встречаются на северо-западе России и в Латгалии, где веками пересекались славянские и балтийские языковые традиции. Суффикс -с вместо привычного -ов или -ин — характерный признак латышской адаптации славянских прозвищ. Если ваши предки носили эту фамилию, они, вероятно, происходили из среды зажиточных крестьян или мелких торговцев, чьё прозвище со временем закрепилось в латышской форме.