Фамилия Зейгермахер — редкий пример немецкого профессионального прозвища, которое закрепилось в русской среде. Её основа составная: от двух немецких слов Seiger («весы» или «часы») и machen («делать», «производить»). Прозвище Зейгермахер, таким образом, буквально означало «весовщик» или «часовщик» — человека, который изготавливал или обслуживал весы и часы. В средневековых немецких городах это была уважаемая ремесленная специальность, часто связанная с цеховой организацией.

Интересна двойственность значения слова Seiger. В южнонемецких диалектах оно означало «часы» (современное Uhr), а в северных и в горном деле — «весы» для взвешивания руды. Поэтому возможны две равноправные версии происхождения: предок носителя фамилии мог быть либо часовых дел мастером, либо торговцем, работавшим с точными весами. Обе профессии требовали высокой квалификации и грамотности.

Фамилия образована по типичной немецкой модели: основа глагола + суффикс деятеля -er (Зейгер-мах-ер). В русском языке она сохранила оригинальное написание без русификации, что указывает на относительно позднее появление её носителей в России — скорее всего, в XVIII–XIX веках, в период приглашения немецких специалистов и ремесленников. Встречается фамилия преимущественно среди потомков немецких колонистов, осевших в Поволжье, Причерноморье и в крупных городах.

В отличие от многих немецких фамилий, переделанных на русский лад (например, Кузнецов из Schmidt), Зейгермахер не получил славянского суффикса -ов или -ин, что делает её легко узнаваемой в документах.