Фамилия Зеймульс — редкий пример, где немецкое происхождение почти не вызывает сомнений, но вот точное значение основы остаётся предметом споров. Скорее всего, она сложена из двух немецких слов: See — «озеро, море» и Mulus — «будущий студент». Такая версия указывает на место жительства предка (у озера или на побережье) и одновременно на его статус или прозвище, связанное с учёбой. По другой гипотезе, первая часть восходит не к существительному See, а к глаголу sein — «быть», что делает фамилию более абстрактной и трудной для однозначной трактовки.

Нельзя исключить и бытовой вариант: в основе лежит слово Semmel — «булочка». Тогда прозвище Зеймульс мог получить либо полный человек, либо булочник, и фамилия образовалась от названия профессии или внешности. Словообразовательная модель здесь нестандартная: в немецких фамилиях редко встречается прямое сращение двух основ без соединительного суффикса, что делает Зеймульс скорее искусственным или канцелярским образованием, чем стихийным прозвищем.

С точки зрения географии, фамилия почти не встречается в современных немецких источниках и в России — это единичный случай, что затрудняет привязку к конкретному региону. Если предки были выходцами из немецких колоний в Поволжье или Причерноморье, фамилия могла быть записана при переселении с искажениями, и исходная форма могла звучать иначе — например, как Зеймус или Займуль. В любом случае, корень указывает на немецкоязычную среду, а суффикс -с нехарактерен для русских фамилий, что подтверждает иноязычное происхождение.