Фамилия Зезулин — редкая и с неочевидной этимологией. В ней нет распространённого суффикса -ов/-ев, а значит, её основа не была притяжательным прилагательным от имени или профессии отца (как Иванов или Кузнецов). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Зезулин — это «чей?» — «сын Зезули».

Вот тут и главная загадка. Что такое «Зезуля» или «Зезуль»? Прямого значения в современном русском языке нет. Самая вероятная версия — это искажённое или диалектное прозвище. В южнорусских и украинских говорах «зезуля» (или «зозуля») — это кукушка. Переход «зозуля» в «зезуля» мог произойти из-за аканья или особенностей местного произношения. Прозвище Кукушка давали либо человеку с характерным голосом, либо тому, кто, как и птица, часто менял место жительства или был одинок. В пользу этой версии говорит и то, что фамилии от названий птиц (Соколов, Воробьёв, Соловьёв) — одни из самых частых в России. Зезулин — редкий вариант того же ряда.

Вторая, менее популярная версия — от глагола «зезулить» (в некоторых говорах — «зевать», «глазеть»). Тогда Зезулей могли прозвать ротозея или зеваку. Но эта гипотеза слабее: глагол мало распространён, и прозвище от него не зафиксировано в известных словарях прозвищ.

Фамилия почти наверняка крестьянская: суффикс -ин в русской традиции чаще всего образовывал фамилии от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (Зезуля → Зезулин). Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, а также на Украине, где слово «зозуля» — обычное. В дворянских родословных Зезулины не числятся, что подтверждает её простонародное происхождение.