Фамилия Жантенова звучит нехарактерно для исконно русской модели, и это подсказка для поиска её корней. Основа — «Жантен» — скорее всего, восходит к мужскому имени или прозвищу Жантен, которое могло быть офранцуженной формой имени Жан (Иван) или производным от французского gentil — «благородный», «изящный». В казахской и тюркской среде, где фамилии часто образовывались от личных имён с помощью притяжательного суффикса -ов/-ев, вариант Жантенов встречается редко, но закономерно: Жантен могло быть заимствованным именем или прозвищем, принесённым в XIX–XX веках через русское посредничество. А вот окончание -ова указывает на женскую форму фамилии — носительница, скорее всего, женщина, а в мужском варианте фамилия писалась бы как Жантенов.

Словообразовательная модель здесь простая: основа Жантен + суффикс -ов (принадлежность) + окончание -а. Такая конструкция типична для русских и русифицированных тюркских фамилий, где суффикс указывал на родство: «чей?» — «Жантенов», то есть потомок человека по имени или прозвищу Жантен. Если смотреть на географию, фамилия Жантенова почти не встречается в центральной России, но может быть зафиксирована у казахов, татар или башкир, особенно в среде, где в XIX веке активно внедрялись русские фамильные окончания. Встречается также вариант Жантенов — например, у известного казахстанского общественного деятеля Ерлана Жантенова, что подтверждает тюркскую привязку.

Более редкая версия — французский след. Среди русских дворян и интеллигенции XIX века было модно давать детям «галантные» имена вроде Жан, Жанно, Жантен. Если предок носителя фамилии был из обрусевших французов или получил такое прозвище за изящные манеры, фамилия могла возникнуть напрямую от французского Gentilhomme (дворянин) в сокращённой форме. Но эта гипотеза слабее: массовых переселений французов в Россию, которые оставили бы такую фамилию, не было, а единичные случаи скорее бы закрепились как Жантильомов или Жанов.

Так что основная версия — тюркская, с заимствованным европейским именем. Предок по мужской линии мог носить имя Жантен, полученное при крещении или как прозвище, а его дети уже стали Жантеновыми. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, имеют корни в смешанной русско-тюркской среде, где пересекались языки и культуры.