Фамилия Жанжакова звучит необычно для русского уха, и это прямо указывает на её корни. С высокой вероятностью, перед нами фамилия тюркского происхождения, адаптированная русской грамматикой. Основа «Жанжак» восходит к тюркским языкам, где «жан» (джан) означает «душа», а «жак» (джак) — «сторона», «бок». Прозвище Жанжак могло означать «душа-сторона» или «родственная душа», то есть близкий, сердечный человек. В некоторых диалектах слово могло иметь значение «любимчик» или «тот, кто за душу».

Суффикс «-ов» в окончании (в женском роде «-ова») — классический русский патронимический формант, который присоединяли к иноязычным основам при «обрусении» фамилии. Обычно так образовывались фамилии у крещёных татар, башкир, казахов или народов Кавказа, переходивших в православие. Мужская форма — Жанжаков — буквально значит «сын Жанжака» или «из рода Жанжака».

География бытования фамилии узкая. Встречается она преимущественно на юге России, в Ставропольском крае, а также в Астраханской области и в некоторых районах Северного Кавказа. Это подтверждает связь с тюркскими и кавказскими этносами. Есть версия, что фамилия могла возникнуть как русифицированная форма кабардинской или ногайской фамилии, где «жанжак» — вариант произношения имени или прозвища.

С точки зрения словообразования, фамилия примечательна тем, что сохранила редкую основу, не частую даже в тюркском ономастиконе. В отличие от массовых фамилий вроде Абдуловых или Ахметовых, Жанжакова не имеет десятков тысяч носителей, что делает её своеобразным маркером конкретного рода или небольшой локальной группы. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не встречается за пределами южных губерний, что говорит о её позднем документальном закреплении — вероятно, в XVIII–XIX веках, при массовом учёте инородческого населения.