Фамилия Жаукимбаев — яркий пример тюркской антропонимической модели, где личное имя или прозвище превратилось в фамилию при помощи характерного суффикса. Разбирать её логичнее всего с конца: компонент «-баев» указывает на происхождение от имени или прозвища, заканчивающегося на «бай». В тюркских языках «бай» — это «хозяин», «господин», «богач», а в составе фамилий часто служило пожеланием богатства и статуса. Таким образом, Жаукимбаев означает «потомок Жаукимбая».

Ключ к пониманию фамилии лежит в основе «Жауким». Скорее всего, это сложное имя, состоящее из двух частей. Первая часть «жау» (или «жауык») в казахском и других тюркских языках имеет несколько значений, из которых наиболее вероятны два: «враг» (жау) или «близкий, прилегающий» (жауык). Вторая часть — «ким» — может быть как самостоятельным словом «кто», так и усечённой формой от «кiсi» (человек). Самая правдоподобная версия: имя Жауким образовано от слов «жау» (враг) и «кiм» (кто) — то есть буквально «кто враг?». В древнетюркской традиции такие имена-вопросы или имена-обереги давали, чтобы запутать злых духов или указать на обстоятельства рождения ребёнка (например, в период вражды). Менее вероятно, но возможно, что «Жауким» — это диалектное искажение имени Жақым (в значении «удобный, подходящий»), но тогда связка с «бай» давала бы значение «удобный богач», что звучит натянуто.

Географически фамилия Жаукимбаев почти наверняка указывает на казахское происхождение. Суффикс «-ев» (вместо исконного казахского «-ұлы» или «-қызы») появился в результате русификации фамилий в XIX–XX веках, когда русская администрация записывала казахов по отчеству с русскими окончаниями. В Казахстане фамилия встречается в основном в южных и западных областях, где сильны традиции имянаречения с компонентом «жау».

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную модель «имя-вопрос», которая в современном казахском языке почти не используется для новых имён. Предки носителя фамилии, скорее всего, были обычными скотоводами или воинами, получившими прозвище за неуступчивый характер или по обстоятельствам рождения. Сословной принадлежности (дворянство, духовенство) у тюркских фамилий такого типа, как правило, не было — это фамилия народа, а не аристократии.