Фамилия Жээнкулова — одна из тех, что сразу выдают своё происхождение за пределами восточнославянского ареала. Её основа, суффикс и география бытования указывают на тюркские, а точнее — на киргизские корни. В русском языке фамилия оформилась через добавление типичного русского суффикса принадлежности -ов, который в женском роде даёт окончание -а. Мужской вариант — Жээнкулов.

Разбираем основу. Она сложная, состоит из двух частей: «жээн» и «кул». Первая часть восходит к киргизскому слову «жээн» (в некоторых диалектах «жээн» или «жиен») — «племянник», «родственник по женской линии». Вторая часть — «кул» — в тюркских языках имеет два значения: «раб» или «слуга», а в составе личных имён часто выступает как компонент, означающий «покорный», «преданный» (например, Аллакул, Худайкул). В киргизской антропонимии «кул» нередко использовалось в именах-оберегах: считалось, что имя, означающее «раб», отпугнёт злых духов и привлечёт благосклонность высших сил.

Таким образом, имя Жээнкул, от которого образована фамилия, можно перевести как «племянник (или родственник), преданный» или «слуга племянника». Второй вариант звучит прозаичнее, но в контексте имён-оберегов более правдоподобен: родители могли назвать сына так, чтобы подчеркнуть его зависимость от старшего родственника, тем самым «спрятав» от сглаза.

С точки зрения социального контекста, фамилия Жээнкулова не несёт указания на дворянское или казачье происхождение — это типичная крестьянская или скотоводческая фамилия, распространённая среди оседлого и кочевого населения Средней Азии. Встречается она преимущественно в Киргизии и среди киргизской диаспоры, а в России — у выходцев из этого региона. В русской среде фамилия редка и воспринимается как экзотическая, хотя её модель образования (основа + -ов) полностью вписалась в систему русских фамилий.