Фамилия Жерженов — довольно редкая, и её разбор сразу ставит перед исследователем вопрос: что за основа «Жержен»? В русской ономастике нет ходового слова с таким корнем, поэтому логичнее всего искать в двух направлениях: либо это искажённое записью прозвище, либо фамилия тюркского происхождения, адаптированная русским суффиксом -ов.

Начнём с версии тюркской. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть основа «жер» — земля, а также слово «жержен» или «жиржен» (с вариантами произношения), которое могло означать «земляной», «привязанный к земле», либо быть личным именем-пожеланием. В таком случае Жерженов — от имени или прозвища Жержен, которое дали человеку, тесно связанному с земледелием, или же ребёнку, чтобы он «прирос» к родной земле, был крепок и богат. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Жержена». Эта версия подкрепляется тем, что фамилия встречается в Поволжье и на Урале, в зоне активного русско-тюркского контакта.

Вторая версия — от искажённого русского прозвища «Жержень». В диалектах русского севера и центра «жержень» или «жерзень» — это стержень, прут, а в переносном смысле — человек худой, высокий и прямой, «жердь». Сравните с фамилией Жерздев (от «жерздь» — жердь). Переход «д» в «н» (жерздень — жержень) не редкость в народной речи, а фамилия могла писаться на слух, без строгой нормы. Тогда Жерженов — потомок долговязого, сухопарого прозвища.

Есть и третий, более редкий путь: от прозвища «Жержен» как варианта «Жердев» или «Жернов», но с тюркским аффиксом. В любом случае, фамилия явно не из центральных, великорусских прозвищ, а с окраин, где языки смешивались. Социально предки Жерженовых — скорее всего, крестьяне или однодворцы (в южных губерниях), либо служилые татары, перешедшие на русскую службу и получившие фамилию по отцу.

Однокоренных фамилий немного: Жерженов, Жержов, Жернов (от «жернов» — мельничный камень), но они не синонимы, а лишь похожи по звучанию. Жерженов — случай, когда одна буква в корне (жерж- вместо жерд-) может указывать на тюркский след или на диалектную русскую речь. Точнее определить можно только по конкретным архивным записям — например, по ревизским сказкам Симбирской или Оренбургской губерний.