Фамилия Жиголкина — женская форма фамилии Жиголкин. Сама фамилия редкая, и её разговорная, почти звукоподражательная основа сразу наводит на мысль о прозвище. Скорее всего, в основе лежит глагол «жигать» — диалектный вариант «жечь», «палить». В южнорусских и украинских говорах «жигнути» означало «стегнуть», «ударить» или «обжечь». Отсюда «жиголка» — это не только колючка, шип (например, у шиповника), но и прозвище для человека бойкого, колкого на язык или того, кто любил подначивать, «поджигать» других. Реже «жиголкой» называли непоседливого, вертлявого человека, который как бы «жжется» в руках. Таким образом, предок носительницы фамилии мог быть острым на слово, задиристым или, наоборот, колючим и нелюдимым — в зависимости от того, какое значение бытовало в его местности.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Жиголкин — «сын Жиголки». То есть прозвище Жиголка было личным именем или уличным прозванием отца, которое затем закрепилось за всем родом. Фамилия эта недворянская и неслужилая — типичная крестьянская или посадская, образованная от бытового прозвища.

География фамилии Жиголкиных узкая. По данным открытых источников, она встречается в основном в центральной России, особенно в Тульской и Рязанской областях, а также в Поволжье. Это совпадает с ареалом говоров, где слово «жиголка» было в ходу. Встречаются и однокоренные фамилии: Жигалов, Жигалкин, Жигулин — все они восходят к тому же корню «жиг-», но с разными суффиксами. Жиголкин стоит особняком: суффикс -олк- в русских фамилиях редок, он придаёт основе оттенок пренебрежительности или уменьшительности (сравните: «сопелка» — «сополка»). Это ещё раз подтверждает, что прозвище было неофициальным, домашним.

Есть и другая, менее вероятная версия: от тюркского имени или слова. В казахском и татарском языках есть слово «жигол» (джигит, удалец), но фонетически и морфологически фамилия Жиголкина выглядит как исконно славянское образование, а не как русифицированное заимствование. Поэтому версия с «жечь» и «колоть» остаётся основной.