Фамилия Жмодиковы (в документальной форме чаще Жмодиков) образована от личного прозвища. В её основе лежит прозвище Жмодик. Чаще всего так называли скупого, прижимистого человека — от глагола «жать», «жму», то есть сжимать, не давать воли. Прозвище было точным и нелестным, но в крестьянской среде такие «домашние» имена давали без злого умысла, скорее для отличия одного человека от другого.

Существует и вторая, менее очевидная версия. Она связывает прозвище с этнонимом «жмудь» — так в русских и польских источниках называли балтское племя жемайтов (самоназвание — жямайчяй), населявшее западную часть современной Литвы. Если принять эту версию, то Жмодик — человек, вышедший из Жемайтии, либо имевший там корни. В этом случае фамилия указывает не на черту характера, а на происхождение предка. Эта гипотеза правдоподобна, если учесть, что на западных рубежах Московского государства и в Речи Посполитой контакты с литовскими землями были постоянными, а прозвища по этническому признаку — частым явлением.

Обе версии имеют право на существование. Словообразовательная модель проста: суффикс -ик в основе (Жмодик) указывает на лицо — носителя признака, а стандартный патронимический суффикс -ов оформляет фамилию по отцу. То есть Жмодиков — буквально «сын Жмодика».

Точное время и место возникновения фамилии установить трудно: процесс закрепления прозвищ в качестве фамилий в разных слоях населения шёл с XV по XVIII век. Однако можно предположить, что фамилия Жмодиковы бытовала в западнорусских и белорусских землях, где влияние балтских языков и соседство с литовскими племенами ощущалось особенно сильно. Именно в этих регионах пересекаются обе версии — и «скупец», и «жмудин».