Фамилия Жомартова — женская форма фамилии Жомартов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем Жомарт. Это имя имеет тюркские корни и широко распространено у казахов, киргизов, татар и других народов, говорящих на языках тюркской группы.

Основа фамилии — имя Жомарт, которое в переводе с казахского и киргизского означает «щедрый», «великодушный». Это не просто характеристика, а распространённое личное имя, которое родители давали ребёнку, желая ему соответствующих качеств. В некоторых диалектах слово «жомарт» также могло означать «благородный», «добрый». Таким образом, фамилия Жомартов (и Жомартова) изначально указывала на предка по имени Жомарт, то есть была отчеством по отцу.

Суффикс -ов (в женском роде -ова) — типичный для русской фамильной модели, которая закрепилась у многих тюркских народов в период вхождения их земель в состав Российской империи. Фамилии на -ов образовывались от имён, прозвищ или профессий отца: «чей сын?» — «Жомартов», то есть сын Жомарта. Встречается и вариант без русификации — Жомарт, но форма с суффиксом стала преобладающей в документах.

Интересно, что в отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ов часто присоединялся к основе, оканчивающейся на согласный, здесь основа на твёрдый согласный -т, что для тюркских имён вполне обычно. Фамилия Жомартова не имеет отношения к географическим названиям или прозвищам, связанным с ремеслом: это чисто патронимическая фамилия, образованная от личного имени с ярко выраженной положительной характеристикой.

Географически фамилия наиболее частотна в Казахстане, Киргизии, а также среди татарского населения России, особенно в Оренбургской, Астраханской областях и Татарстане. Встречаемость её невысока, что делает её довольно редкой и локально привязанной к регионам традиционного проживания тюркских народов.