Фамилия Жудра — редкий случай среди русских фамилий: её основа не имеет очевидных славянских параллелей, а само слово выглядит заимствованным или диалектным. В отличие от фамилий на -ов, которые образуются от крестильных имён (Иванов, Петров), Жудра стоит особняком. Суффикса в ней нет — это чистая основа, оформленная как фамилия без типового родового окончания. Такие «голые» фамилии в русской традиции встречаются редко и обычно указывают на украинское, белорусское или южнорусское происхождение.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Жудра. В украинских и белорусских говорах «жудра» или «жудрый» могло означать «тот, кто жует», «медлительный человек» или, наоборот, «ворчун». Есть версия, что слово связано с литовским žudyti — «убивать», но для прозвища это значение слишком мрачное и маловероятное в бытовой среде. Более правдоподобно, что Жудра — вариант фамилии Жура (от «журавль») с диалектным вставным «д», но это лишь гипотеза.

Географически фамилия привязана к западным регионам: чаще всего её носители встречаются в Беларуси, на Смоленщине и в Брянской области. В XIX веке Жудры могли быть крестьянами или мещанами — фамилия не дворянская и не купеческая, что подтверждается её отсутствием в родословных книгах.

Попытки вывести фамилию из еврейского или тюркского корня выглядят натянутыми: ни в одном из этих языков нет близкого по звучанию слова, которое давало бы осмысленное прозвище. Самая рабочая версия — украинско-белорусское диалектное прозвище, которое закрепилось как фамилия без изменений.