Фамилия Жугинисов — яркий пример того, как в русской фамильной модели закрепилось тюркское прозвище. Её основа — слово «жугинис» (варианты произношения: жүгініс, жуғыныс), которое в казахском и ряде других тюркских языков означает «поклон», «земной поклон» или «мольба». Человек, получивший такое прозвище, мог быть глубоко верующим, набожным, либо, наоборот, отличаться особой почтительностью и смирением в поведении. Встречается и более бытовая трактовка: так могли назвать того, кто кланялся при встрече ниже всех, или, в ироничном ключе, — льстеца.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для южнорусских и казахстанских регионов. К основе «Жугинис» добавился русский патронимический суффикс -ов, который в данном случае указывает на принадлежность: «сын Жугиниса». Таким образом, фамилия — это не прямое прозвище, а отчество, застывшее в третьем поколении. Интересно, что в отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), суффикс -ов здесь присоединился к тюркской основе, сохранившей конечный согласный, что для XVIII–XIX веков было нормой при русификации нерусских имён.

Географически фамилия Жугинисов тяготеет к зоне активного русско-казахского пограничья — Оренбуржью, Астраханской области, Западному Казахстану. В метрических книгах XIX века её носители чаще всего записаны как государственные крестьяне или казаки (особенно в Уральском и Оренбургском казачьих войсках). Это говорит о том, что предки Жугинисовых не были кочевниками: они вели оседлый образ жизни, занимались земледелием или несли сторожевую службу, но сохранили в родовой памяти тюркское имя.

В написании фамилии возможны вариации: Жугинисов, Жугинисовъ (до реформы 1918 года), реже — Жугинис (без суффикса, что встречается у потомков, не прошедших полную русификацию). Важно не путать её с похожими фамилиями вроде Жугин или Жугинов — те образованы от другой основы (жуга, жугун — «сажа» или «горе»), и их семантика совершенно иная.