Фамилия Жумагатов — яркий пример тюркской модели образования фамилий, где к основе личного имени добавили русский патронимический суффикс -ов. Встречается она прежде всего у казахов, киргизов, татар и башкир, то есть у народов, где арабское имя Джума (Жума) было широко распространено. Разница в написании — через «Ж» или «Дж» — отражает особенности произношения в разных языках: в казахском и киргизском начальный звук смягчается до «ж», в татарском чаще сохраняется «дж».

Основа фамилии — имя Жумагат (Жумагата). Это составное имя из двух частей: «Жума» (пятница, священный день у мусульман) и «гат» (араб. «дающий», «одаряющий»). В буквальном смысле имя означает «дарованный в пятницу» или «подарок пятницы». Такие имена давали мальчикам, родившимся в этот день недели, — традиция, распространённая во многих тюрко-мусульманских культурах. Встречаются и другие варианты этого имени: Жумабай, Жумабек, Жумахан — все они складываются по одной схеме «Жума + вторая часть», обозначающая статус или пожелание.

Фамилия Жумагатов — сравнительно поздняя, как и большинство фамилий у тюркских народов. Массово они закреплялись в первой половине XX века, в ходе советского паспортного учёта. До этого люди чаще обходились личным именем с указанием отца (например, Жумагат Ахметулы). Поэтому предки носителя фамилии, скорее всего, были простыми скотоводами или земледельцами, а само имя Жумагат передавалось в роду как память о дне рождения первопредка.

В русском языке фамилия склоняется по правилам мужских фамилий на -ов: нет Жумагатова, дать Жумагатову. Женский вариант не изменяется. Встречаются варианты с ударением на второй или третий слог, но это уже местная особенность произношения.