Фамилия Жусубаева — типичная для казахской и киргизской ономастики патронимическая фамилия, образованная от мужского личного имени Жусубай. Это имя, в свою очередь, составное, и его разбор сразу проясняет значение фамилии.

Первая часть имени — Жусуп — это арабская огласовка библейского имени Иосиф (Йусуф). В переводе с древнееврейского оно означает «божья награда» или «приумножающий». Вторая часть — «бай» — классический тюркский компонент, который в прошлом обозначал хозяина, богатого и уважаемого человека, господина. Таким образом, имя Жусубай можно перевести как «богатый, как Йусуф» или «господин, данный Богом».

Женский вариант фамилии Жусубаева, как и большинство фамилий на -ов/-ев в тюркских языках, не меняет форму по родам, а лишь указывает на принадлежность к роду Жусубаевых. В отличие от русской модели, где суффикс -ев указывает на «сына» или «внука» человека по имени, в казахской традиции фамилии на -ев (и их женские формы) закрепились в советский период как стандартный способ оформления родового имени.

Говорить о точном месте возникновения рода Жусубаевых без генеалогического исследования сложно: имя Жусубай встречается у разных тюркских народов, но наиболее распространено среди казахов и киргизов. Интересно, что в русских документах XIX века это имя могло записываться по-разному: Жусупбай, Жусубек или даже Зюсюбай, что связано с особенностями передачи арабской фонетики через кириллицу. Фамилия же закрепилась именно в форме Жусубаев — с усечением второго компонента «бай» до основы, что является распространённой моделью для фамилий, образованных от составных имён.