Фамилия Жужунечкинов — редкий случай, когда за длинной цепочкой суффиксов стоит не столько профессия или географическое название, сколько звукоподражательное прозвище. Основа здесь — «жужунечка», уменьшительно-ласкательная форма от «жужуня» или «жужунек». А те, в свою очередь, восходят к глаголу «жужжать». В русских говорах «жужуней» могли называть человека, который постоянно бормочет, ворчит себе под нос или, наоборот, любит поболтать без умолку — вроде жужжащей мухи. В некоторых диалектах так могли прозвать и непоседливого ребёнка, который всё время вертится и издаёт невнятные звуки.

Словообразовательная модель фамилии необычна. Обычно фамилии образуются от полных прозвищ: Жук → Жуков, Жужжало → Жужжалов. Здесь же мы видим тройную цепочку уменьшительных суффиксов: корень «жуж-» + суффикс «-ун-» (жужун), потом «-ечк-» (жунунечка) и, наконец, «-ин-» (Жужунечкин). Финальный суффикс «-ов» в форме «-ов» добавил уже при оформлении фамилии. Такая многоступенчатая ласкательная форма — признак того, что прозвище давали в семье или в очень близком кругу, где человека называли не по злой черте, а с долей иронии или нежности. Получается, что предок носителя фамилии был скорее «жужжалкой», чем «жужжалой».

Географически фамилия почти не встречается за пределами центральных и северных областей России. В южных говорах «жужуней» чаще заменяли «гундосей» или «ворчуном». Встретить Жужунечкинова можно в архивах Тверской, Вологодской или Костромской губерний — регионах, где сохранилась традиция создавать прозвища из звукоподражаний и где суффикс «-ечк» в фамилиях встречается чаще, чем в других местах.

В отличие от фамилий типа Жужжалкин или Жужжалов, которые прямо указывают на действие, Жужунечкинов — фамилия «домашняя», камерная. Она говорит не столько о ремесле или социальном статусе, сколько о характере или привычке. Скорее всего, первый носитель фамилии был человеком незлобивым, но словоохотливым, которого в деревне знали как «нашего жужуню» — того, кто всегда найдёт, о чём поговорить.