Фамилия Зибухина — женская форма фамилии Зибухин, и её разбор стоит начать с неочевидного, но показательного суффикса. В русских фамилиях суффикс -ин обычно указывает на принадлежность: чей? — Зибухин, то есть сын или потомок Зибуха. Сама основа «Зибух» в современном русском языке не встречается, но зато отчётливо слышна в диалектах и старых прозвищах.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Зибуха, образованное от глагола «зибать» — диалектного варианта «зыбать», что значит «качать, колыхать, колебать». В северных и сибирских говорах «зибать» или «зыбать» употреблялось активно: зыбкой называли колыбель, зыбуном — топкое место. Человек, получивший прозвище Зибуха, мог быть непоседой, вертлявым, или, наоборот, тем, кто качает люльку, нянчит детей. Возможна и более прямая связь с родом занятий — например, изготовителем зыбок (люлек) или перевозчиком на зыбких болотистых участках.

Менее вероятна, но не исключена версия от тюркского корня «зиб» (красивый, нарядный) с добавлением русского суффикса -ух(а). Такие гибридные прозвища встречались в пограничных с тюркскими народами регионах, но для фамилии Зибухин это редкий случай. Правдоподобнее всё же славянская основа, тем более что в псковских и тверских говорах слово «зыбуха» фиксировалось в значении «болтушка, сплетница» — ещё один возможный источник прозвища.

Фамилия Зибухин — относительно редкая. Встречается в основном в центральных и северных областях России, а также среди старообрядческих семей. Суффикс -ин указывает на древнюю модель образования: такие фамилии чаще возникали в крестьянской и посадской среде, где прозвище отца или деда закреплялось за детьми без изменений. Дворянских родов с такой фамилией история не знает — это фамилия простых людей, чьё прозвище живёт уже несколько столетий.