Фамилия Зиенко — типичный пример восточнославянской фамилии, образованной с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -енко. Этот суффикс особенно характерен для украинской ономастики и означает «маленький» или «сын такого-то». То есть Зиенко — это буквально «сын Зиена» или «потомок Зиена». Само прозвище Зиен, от которого всё пошло, имеет несколько версий происхождения, и все они по-своему интересны.

Самая прямая версия связывает прозвище Зиен с глаголом «зиять» — раскрывать рот, зевать. В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком с заметной привычкой зевать или говорить с широко открытым ртом. Такие прозвища по поведению — один из древнейших пластов русских и украинских фамилий.

Вторая версия уводит нас в тюркские языки. Слово «зиһен» (zihin) в турецком и крымскотатарском означает «разум, сознание, сообразительность». В этом случае Зиен — прозвище умного, толкового человека. Такая трактовка правдоподобна, учитывая долгие контакты славянского населения с тюркскими народами в южнорусских и украинских степях.

Третья, менее вероятная гипотеза, выводит прозвище от тюркского «зиён» — «вред, убыток». Так могли назвать неловкого человека, который часто что-то портил или ломал. Однако эта версия слабее: прозвища со значением «убыток» встречаются реже, чем прозвища по чертам характера или внешности.

Фамилия Зиенко распространена преимущественно в Украине и на юге России. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Зиенко, что не меняет сути. Среди однокоренных фамилий можно назвать Зиенков, Зиенковский, а также более редкие Зиенко-Ковальчук в двойных фамилиях.

Таким образом, носитель фамилии Зиенко может с равной вероятностью вести род от зевающего простака или от острого на язык умника — обе версии имеют под собой языковую почву.