Фамилия Зинира — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые образованы от крестильных имён (Иванов, Петров) или прозвищ, Зинира почти наверняка не имеет славянских корней. Основа фамилии — женское имя Зинира, которое встречается у тюркских народов, особенно у татар и башкир. В этом имени прослеживается арабское влияние: оно может восходить к слову «зинар» (украшение, пояс) или быть сложносоставным, где вторая часть — «нира» (свет, сияние). Таким образом, имя Зинира могло означать «сияющее украшение» или «светлый пояс».

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе имени Зинир- добавлен русский патронимический суффикс -а, который в женском роде выполняет функцию окончания. В русской традиции фамилии на -а, образованные от имён, обычно указывают на принадлежность к роду: Зинира — «дочь или жена того, кого зовут Зинир». Однако важно отметить, что в мужском варианте фамилия, скорее всего, склонялась бы как Зинирин (по аналогии с Ильин, Пушкин), если бы носителем был мужчина. То, что фамилия закрепилась в форме Зинира, — дополнительный аргумент в пользу её тюркского происхождения: у татар и башкир фамилии нередко оставались в неизменной форме, совпадающей с именем предка.

Географически фамилия Зинира тяготеет к регионам Поволжья и Приуралья — Татарстану, Башкортостану, а также к соседним областям, где исторически жили тюркские народы. Встречается она крайне редко, и в метрических книгах XIX века её почти не найти: скорее всего, фамилия возникла поздно, в советское время, когда при паспортизации тюркские имена и отчества часто записывали в упрощённом, русифицированном виде. Предки носителей фамилии могли быть крестьянами или ремесленниками, но точных сведений о сословной принадлежности нет — слишком мало данных.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет. Можно вспомнить разве что Зинатуллин или Зиятдинов, но они образованы от других арабских корней. Зинира стоит особняком: это не переделка русского имени, а прямая калька с тюркского женского имени, которая неожиданно стала фамилией.