Фамилия Зонис — одна из тех, что сохранила в себе уменьшительное имя, которое со временем стало родовым. Её основа — имя Зоня, а это в еврейской (идишской) традиции ласкательная или обиходная форма имени Соломон. Имя Соломон восходит к древнееврейскому корню со значением «мир» или «цельный, совершенный»; в библейской истории его носил третий царь Израиля, которому приписывают авторство нескольких книг Ветхого Завета.

Модель образования здесь простая и прозрачная: к основе Зон- добавился суффикс -ис. Такое оформление фамилии — не через привычные русские -ов, -ин или -ский, а через -ис — указывает на ашкеназский ареал. В восточноевропейской еврейской ономастике суффикс -ис (как и -ес, -ас) часто присоединяли к личным именам и прозвищам, создавая фамилии, которые закреплялись в документах Российской империи, Австро-Венгрии или Румынии.

География фамилии подтверждает эту связь. В Книге памяти Республики Коми встречается Меер Янкелевич Зонис, родившийся в 1916 году в селе Новотатаровка Бессарабии — исторической области на стыке современных Молдовы и Украины. Одесские архивные записи фиксируют Михаила Наумовича Зониса (1921 года рождения) и Наума Исааковича Зониса (1893 года рождения). Все эти точки — Бессарабия, Одесса — входили в черту оседлости, где в XIX — начале XX века активно формировались фамилии по такой модели.

Если сравнивать Зонис с однокоренными фамилиями, сразу видна разница в суффиксах: Зонов, Зонин, Зонский — это варианты, адаптированные под славянскую словообразовательную норму. Зонис же сохранил более редкий и характерный именно для ашкеназской традиции формант. Поэтому по одной только фамилии можно с большой вероятностью определить, что её носители происходят из еврейских местечек юго-запада Российской империи, а родоначальника в быту звали Зоня — уменьшительно от Соломона.