Фамилия Зудочкины (в мужском варианте — Зудочкин) ведет свою историю от прозвища или нецерковного имени Зудочка. В основе лежит диалектное слово «зуда», которое в разных говорах означало либо «непоседливый, надоедливый человек», либо «чесотка, кожная сыпь». Отсюда расходятся две версии происхождения.

Первая, бытовая: прозвище Зудочка дали человеку с беспокойным, суетливым характером — такому, которого в других местах назвали бы Егозой или Непоседой. Прозвище закреплялось за ним в кругу семьи или соседей и со временем перешло в фамилию.

Вторая версия — охранительная, или обереговая. В древнерусской традиции родители нередко давали детям «отрицательные» имена, чтобы уберечь от болезней. Назвав младенца Зудочкой (от «зуда» — чесотка, сыпь), семья как бы обманывала злые силы: мол, ребенок и так уже «больной», значит, настоящая хворь его не тронет. Такие имена-обереги были особенно распространены в крестьянской среде до XVIII века.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: к основе Зудочк- добавился суффикс притяжательности -ин, указывающий на принадлежность «сын Зудочки». Суффикс -к- в прозвище Зудочка, скорее всего, уменьшительно-ласкательный, что типично для внутрисемейных именований. Модель на -ин характерна для фамилий, образованных от слов женского рода (на -а/-я), и в этом смысле Зудочкин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Сорокин, Птичкин, Козочкин.

По сравнению с однокоренными фамилиями Зудин, Зудов, Зударев — Зудочкин стоит особняком: в ней отчетливо видна уменьшительная форма, что говорит о более личном, домашнем происхождении. Скорее всего, предок носителей этой фамилии был известен в своем кругу именно под ласковым или ироничным прозвищем Зудочка, а не под грубоватым Зуда.

Точное время и место возникновения фамилии установить сложно: такие «говорящие» прозвища могли появиться независимо в разных губерниях. Однако фамилии на -ин с основой на -очк- чаще встречаются в северных и центральных областях России, где была сильна традиция некалендарных имен. Для серьезных генеалогических изысканий нужно обращаться к архивным документам конкретной местности — метрическим книгам и ревизским сказкам.