Фамилия Зусиков образована от прозвища или нецерковного имени Зусик. Если смотреть на типичную модель, то перед нами отчество второй степени: Зусик — Зусиков, то есть «сын Зусика». Суффикс -ов указывает на принадлежность, характерную для русских фамилий, окончательно закрепившихся в XV–XVII веках. Сама основа Зусик — это уменьшительно-ласкательная форма от имени Зусь, которое, в свою очередь, могло быть народным вариантом канонического имени Зосима. В просторечии Зосиму часто называли Зосей, Зуськой, отсюда и Зусик.

Есть и другая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование. В некоторых южнорусских и украинских говорах «зусь» или «зусик» могло означать что-то вроде «зубоскал», «насмешник» — от слова «зубы» в переносном значении (скалить зубы, зубоскалить). Однако в пользу первой версии говорит распространённость имён Зосима и его производных в крестьянской среде, особенно в центральных и северных губерниях России.

Фамилия редкая и географически локализована. По данным открытых источников, большинство Зусиковых встречается в Ростовской области и на юге России, что может указывать на миграцию из центральных областей или на смешение с украинским населением, где форма Зусь встречается чаще. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется в основном среди крестьян и мещан.

Словообразовательная модель типична: суффикс -ик образует уменьшительное имя, а затем к нему добавляется патронимический суффикс -ов. Подобные фамилии (Кузиков, Вазиков, Лозиков) строятся по тому же принципу, но Зусиков отличается редкостью основы — имя Зусик почти не встречается в современных документах, что делает фамилию своеобразным «археологическим» следом забытой народной формы имени.