Фамилия Зуссе — один из тех случаев, когда написание обманчиво просто, а происхождение уходит в две разные языковые стихии. Короткая, без суффиксов, она сразу указывает на то, что перед нами не «русская» фамилия в классическом понимании (с окончаниями -ов, -ин, -ский), а фамилия-прозвище, застывшая в исходной форме.

Вероятнее всего, Зуссе — это немецкая фамилия, записанная кириллицей. В немецком языке слово süß (произносится «зюс») означает «сладкий», «милый», «приятный». Окончание -е в русской передаче могло появиться как дань традиции транслитерации (ср. Гёте, Шиллер). В этом случае фамилия Зуссе — бывшее прозвище, которое дали человеку с мягким, покладистым характером, либо же кондитеру или торговцу сладостями. Менее вероятно, но возможно, что это вариант фамилии Зюсс (Süß) с добавлением -е для благозвучия.

Вторая версия, менее известная, но имеющая право на существование, — еврейское происхождение. В ашкеназской среде встречалась фамилия Зус (Suss) или Зусман, восходящая к древнееврейскому имени Йосеф (Иосиф) через уменьшительную форму. Фамилия Зуссе могла быть её фонетическим вариантом или производной формой. В пользу этой версии говорит то, что в Российской империи немецкие и еврейские фамилии часто записывались на слух, и местные писцы могли зафиксировать «Зуссе» там, где в оригинале было «Зюс» или «Зус».

Географически фамилия редкая. В дореволюционных метрических книгах и переписях она встречается в основном на западе и юге Российской империи — в черте оседлости (Волынская, Подольская губернии) и в немецких колониях Поволжья. Носители фамилии, скорее всего, были либо немецкими колонистами, либо еврейскими ремесленниками (пекарями, кондитерами). Сословный состав смешанный: от мещан до купцов, но без дворянских корней.

Особенность фамилии в том, что её не «русифицировали» добавлением окончаний. Она так и осталась в языке как заимствованное слово-прозвище. Это делает её ценным маркером для генеалогического поиска: если вы встретили Зуссе в документах, велика вероятность, что предки были носителями немецкого или идиша и переселились в Россию не ранее XVIII века.