Фамилия Зусси — редкий для России случай, когда корень не славянский, а суффикс — типично русский. Это фамилия-гибрид, и её происхождение почти всегда ведёт в еврейскую среду Восточной Европы.

Основа фамилии — мужское личное имя Зус (Zus) или его вариант Зусси (Zussi). В ашкеназской традиции это сокращённая форма библейского имени Иегошуа (Иисус Навин) или, реже, имени Зелиг (Zelig, «блаженный»). В быту еврейские имена часто усекали до одного-двух слогов: так Иегошуа превращался в Зусе, Зуся, а ласкательная форма звучала как Зусси. В некоторых диалектах идиша «зус» могло означать «сладкий» или «милый», что делало имя прозвищным по смыслу.

Суффикс -и в русской передаче выполняет ту же роль, что и -ов или -ин: он превращает личное имя в фамилию, отвечающую на вопрос «чей?». То есть Зусси — это «сын Зусси» или «человек из семьи Зусси». Такая модель встречается в основном у фамилий, записанных с юго-западных территорий Российской империи (Беларусь, Украина, Польша), где под влиянием польского языка суффикс -и был распространён шире, чем в великорусских губерниях.

Географически фамилия Зусси встречается фрагментарно. В дореволюционных метрических книгах её можно найти в местечках Волынской, Киевской и Могилёвской губерний. После Холокоста и миграций XX века носители рассеяны по Израилю, США и Германии; в современной России фамилия остаётся единичной.

Спорных версий здесь немного. Иногда Зусси пытаются вывести из немецкого «süß» (сладкий) или из славянского «зус» (диалектное «сор»), но это натяжки: имя Зусси документально зафиксировано в еврейских общинах как минимум с XVIII века, а славянского корня «зус» в значении личного имени не существует. Таким образом, самая надёжная версия — еврейское патронимическое прозвище от сокращённого библейского имени.

По сословному составу предки Зусси, скорее всего, были мещанами или ремесленниками — портными, сапожниками, торговцами. Фамилия не дворянская и не крестьянская в классическом русском понимании, а типичная для местечкового еврейства, где фамилии закрепились в первой половине XIX века по указу о всеобщей переписи.