Фамилия Зюзков образована от прозвища или нецерковного имени Зюзька, а то, в свою очередь, — от слова «зюзя». В русских говорах «зюзя» — это мокрый, промокший до нитки человек, а также неряха или разиня. В словаре Даля «зюзя» определяется как «мокрый, вымокший»; отсюда же и поговорка «ходить зюзей» — быть в мокрой, грязной одежде. Прозвище могли дать неаккуратному человеку или тому, кто часто попадал под дождь, работал у воды.

Суффикс -к- в основе Зюзьк-а уменьшительно-пренебрежительный, он нередко встречается в древнерусских именах и прозвищах (Сенька, Ванька, Митька). Форма Зюзков — типичная патронимическая фамилия на -ов, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Зюзьки. Такой способ образования был самым массовым в северо-восточной Руси, особенно в среде крестьян и служилых людей.

Есть и другая, менее вероятная версия: в некоторых диалектах «зюзя» означала «пьяница» (от глагола «зюзюкать» — пить, пьянствовать). Однако основное значение всё же связано с мокрым или неопрятным видом. Поскольку прозвище не оскорбительное, а бытовое, оно могло закрепиться за родом без негативного оттенка.

Географически фамилия Зюзков встречается в основном в центральных и северных областях России — Вологодской, Костромской, Кировской, а также на Урале. В некоторых переписях XVII–XVIII веков встречаются крестьяне с этой фамилией в Вотской пятине и на Вятке. Известных дворянских родов Зюзковых не зафиксировано — фамилия почти наверняка крестьянская или посадская.

Однокоренные фамилии — Зюзин, Зюзькин, Зюзев, Зюзиков. Ударение в фамилии Зюзков обычно падает на первый слог, хотя в разговорной речи иногда смещается на второй.